Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc172Q810N9 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms