Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ChfrQ810L3 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms