Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cfap100Q80VN0 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms