Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM3

Ttc29, Tetratricopeptide repeat protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc29Q80VM3 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ttc29Q80VM3 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms