Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpp38Q80UU2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpp38Q80UU2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Rpp38Q80UU2 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Rpp38Q80UU2 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Rpp38Q80UU2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rpp38Q80UU2 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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