Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ttll4Q80UG8 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ttll4Q80UG8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms