Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Aamp-202ENSMUST00000178235 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Ube2q1Q7TSS2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2q1Q7TSS2 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2q1Q7TSS2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2q1Q7TSS2 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Ube2q1Q7TSS2 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ube2q1Q7TSS2 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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