Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Dsg1bQ7TSF1 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms