Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Zfp397Q7TNK4 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Zfp397Q7TNK4 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms