Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sbno2Q7TNB8 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sbno2Q7TNB8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms