Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
ScocQ78YZ6 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
ScocQ78YZ6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms