Protein–RNA interactions for Protein: Q78XR0

Trappc6a, Trafficking protein particle complex subunit 6A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6aQ78XR0 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trappc6aQ78XR0 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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