Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GypcQ78HU7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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GypcQ78HU7 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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GypcQ78HU7 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GypcQ78HU7 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms