Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Topbp1Q6ZQF0 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms