Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR4

Kcnt1, Potassium channel subfamily T member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Kcnt1Q6ZPR4 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms