Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ssx9Q6XAS3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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