Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SvoplQ6PDF3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
SvoplQ6PDF3 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms