Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp49Q6P9L4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp49Q6P9L4 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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