Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tpm4Q6IRU2 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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