Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smarca2Q6DIC0 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms