Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
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Pdzrn3Q69ZS0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pdzrn3Q69ZS0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Pdzrn3Q69ZS0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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