Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fgd6Q69ZL1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms