Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Lrrcc1Q69ZB0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms