Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sbno1Q689Z5 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Sbno1Q689Z5 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sbno1Q689Z5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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Sbno1Q689Z5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
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Sbno1Q689Z5 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sbno1Q689Z5 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
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Sbno1Q689Z5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sbno1Q689Z5 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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