Protein–RNA interactions for Protein: Q67DU8

Clec4b2, Antigen presenting cell lectin-like receptor A1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b2Q67DU8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Clec4b2Q67DU8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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