Protein–RNA interactions for Protein: Q64519

Sdc3, Syndecan-3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc3Q64519 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Sdc3Q64519 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Sdc3Q64519 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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