Protein–RNA interactions for Protein: Q64310

Surf4, Surfeit locus protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Surf4Q64310 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Surf4Q64310 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Surf4Q64310 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms