Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Irf4Q64287 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
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Irf4Q64287 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Irf4Q64287 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Irf4Q64287 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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