Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

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Length 576 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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Zfp248Q640N4 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Zfp248Q640N4 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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