Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc18Q640L5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc18Q640L5 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
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