Protein–RNA interactions for Protein: Q62393

Tpd52, Tumor protein D52, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52Q62393 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Tpd52Q62393 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Tpd52Q62393 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms