Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Itga6Q61739 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Itga6Q61739 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms