Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Abcd2Q61285 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms