Protein–RNA interactions for Protein: Q61282

Acan, Aggrecan core protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AcanQ61282 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
AcanQ61282 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms