Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Nell2Q61220 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Nell2Q61220 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nell2Q61220 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nell2Q61220 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms