Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Usf1Q61069 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Usf1Q61069 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
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