Protein–RNA interactions for Protein: Q60925

Dbp, D site-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DbpQ60925 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DbpQ60925 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms