Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Slc6a4Q60857 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Slc6a4Q60857 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms