Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm43052-201ENSMUST00000201451 1628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mkrn3Q60764 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms