Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rnf123Q5XPI3 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms