Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms