Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Sft2d1Q5SSN7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms