Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC3

Trim41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim41Q5NCC3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim41Q5NCC3 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim41Q5NCC3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms