Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rtl5Q5DTT4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms