Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

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Length 1,511 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ccdc163-204ENSMUST00000106464 1213 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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Znf608Q56A10 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Znf608Q56A10 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms