Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL78

Khdc1c, KH homology domain-containing protein 1C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc1cQ4KL78 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Khdc1cQ4KL78 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Khdc1cQ4KL78 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms