Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Syne3Q4FZC9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Syne3Q4FZC9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Syne3Q4FZC9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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