Protein–RNA interactions for Protein: Q497P9

Gm5941, MCG112829, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5941Q497P9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Gm5941Q497P9 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Gm5941Q497P9 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms