Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 AC132384.10-201ENSMUST00000217862 1204 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm24541-201ENSMUST00000103871 96 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm38247-201ENSMUST00000194675 433 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lrrc43Q3V0L5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm45151-201ENSMUST00000205445 712 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lrrc43Q3V0L5 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms