Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp48Q3V0C5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Usp48Q3V0C5 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp48Q3V0C5 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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Usp48Q3V0C5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp48Q3V0C5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms